MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011987	TCG	2	6	289654	289659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5002	NC_011987	CGTG	2	8	289719	289726	0 %	25 %	50 %	25 %	222102240
5003	NC_011987	AGTC	2	8	289880	289887	25 %	25 %	25 %	25 %	222102240
5004	NC_011987	ATC	2	6	289896	289901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102240
5005	NC_011987	ACG	2	6	289975	289980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5006	NC_011987	CCTCTT	2	12	290033	290044	0 %	50 %	0 %	50 %	222102240
5007	NC_011987	GGC	2	6	290064	290069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102240
5008	NC_011987	GGC	2	6	290097	290102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102240
5009	NC_011987	GCTG	2	8	290108	290115	0 %	25 %	50 %	25 %	222102240
5010	NC_011987	GCG	2	6	290146	290151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102240
5011	NC_011987	AGC	2	6	290164	290169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5012	NC_011987	CGA	2	6	290246	290251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5013	NC_011987	GATC	2	8	290339	290346	25 %	25 %	25 %	25 %	222102240
5014	NC_011987	CGG	2	6	290363	290368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102240
5015	NC_011987	CGC	2	6	290396	290401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102240
5016	NC_011987	TCG	3	9	290458	290466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5017	NC_011987	ACG	3	9	290467	290475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5018	NC_011987	GAA	2	6	290541	290546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102240
5019	NC_011987	GAC	2	6	290556	290561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102240
5020	NC_011987	TCA	2	6	290577	290582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102240
5021	NC_011987	AG	3	6	290590	290595	50 %	0 %	50 %	0 %	222102240
5022	NC_011987	ACG	2	6	290684	290689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5023	NC_011987	CAG	2	6	290993	290998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5024	NC_011987	AGA	2	6	291001	291006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102241
5025	NC_011987	CGG	2	6	291109	291114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102241
5026	NC_011987	CGA	2	6	291157	291162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5027	NC_011987	GCC	2	6	291171	291176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102241
5028	NC_011987	GTC	2	6	291188	291193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5029	NC_011987	GCC	2	6	291194	291199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102241
5030	NC_011987	TCCG	2	8	291214	291221	0 %	25 %	25 %	50 %	222102241
5031	NC_011987	GAG	2	6	291224	291229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102241
5032	NC_011987	GCT	2	6	291239	291244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5033	NC_011987	GAAA	2	8	291295	291302	75 %	0 %	25 %	0 %	222102241
5034	NC_011987	TCGG	2	8	291339	291346	0 %	25 %	50 %	25 %	222102241
5035	NC_011987	GCGT	2	8	291351	291358	0 %	25 %	50 %	25 %	222102241
5036	NC_011987	GTC	2	6	291377	291382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5037	NC_011987	TGG	2	6	291418	291423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102241
5038	NC_011987	CGC	2	6	291440	291445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102241
5039	NC_011987	CAG	2	6	291459	291464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102241
5040	NC_011987	CGC	2	6	291484	291489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102241
5041	NC_011987	GC	3	6	291494	291499	0 %	0 %	50 %	50 %	222102241
5042	NC_011987	GGCG	2	8	291576	291583	0 %	0 %	75 %	25 %	222102241
5043	NC_011987	TC	3	6	291597	291602	0 %	50 %	0 %	50 %	222102242
5044	NC_011987	CTCG	2	8	291607	291614	0 %	25 %	25 %	50 %	222102242
5045	NC_011987	GGC	2	6	291628	291633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102242
5046	NC_011987	CG	3	6	291682	291687	0 %	0 %	50 %	50 %	222102242
5047	NC_011987	AGC	2	6	291712	291717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5048	NC_011987	ACC	2	6	291752	291757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102242
5049	NC_011987	GAC	2	6	291817	291822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5050	NC_011987	G	6	6	291852	291857	0 %	0 %	100 %	0 %	222102242
5051	NC_011987	ACC	2	6	291860	291865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102242
5052	NC_011987	CCG	2	6	291893	291898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102242
5053	NC_011987	GCA	2	6	292000	292005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5054	NC_011987	GAC	2	6	292009	292014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5055	NC_011987	GAC	2	6	292017	292022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5056	NC_011987	CGCCT	2	10	292039	292048	0 %	20 %	20 %	60 %	222102242
5057	NC_011987	TGG	3	9	292077	292085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102242
5058	NC_011987	CAT	2	6	292098	292103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102242
5059	NC_011987	CCG	2	6	292117	292122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102242
5060	NC_011987	GTG	2	6	292258	292263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102242
5061	NC_011987	GAT	2	6	292321	292326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102242
5062	NC_011987	TGG	2	6	292412	292417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102242
5063	NC_011987	ACT	2	6	292628	292633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102242
5064	NC_011987	GCA	2	6	292743	292748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
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5066	NC_011987	GAA	2	6	292792	292797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102242
5067	NC_011987	GACTAC	2	12	292831	292842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222102242
5068	NC_011987	ACG	2	6	292862	292867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102242
5069	NC_011987	GCA	2	6	292914	292919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102243
5070	NC_011987	CGT	2	6	293007	293012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102243
5071	NC_011987	CGG	2	6	293187	293192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102243
5072	NC_011987	CGT	2	6	293250	293255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102243
5073	NC_011987	GAA	2	6	293259	293264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102243
5074	NC_011987	CA	3	6	293282	293287	50 %	0 %	0 %	50 %	222102243
5075	NC_011987	GCG	2	6	293303	293308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102243
5076	NC_011987	CAT	3	9	293310	293318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102243
5077	NC_011987	AC	3	6	293337	293342	50 %	0 %	0 %	50 %	222102243
5078	NC_011987	CCT	2	6	293390	293395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102243
5079	NC_011987	CTG	2	6	293419	293424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102243
5080	NC_011987	CGT	2	6	293463	293468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102243
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5083	NC_011987	GC	3	6	293525	293530	0 %	0 %	50 %	50 %	222102243
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5087	NC_011987	ACGA	2	8	294531	294538	50 %	0 %	25 %	25 %	222102244
5088	NC_011987	GGC	2	6	294579	294584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102244
5089	NC_011987	TTC	2	6	294647	294652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102244
5090	NC_011987	TTG	2	6	294659	294664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102244
5091	NC_011987	GGC	2	6	294685	294690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102244
5092	NC_011987	ATTAT	2	10	294694	294703	40 %	60 %	0 %	0 %	222102244
5093	NC_011987	GCG	2	6	294704	294709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102244
5094	NC_011987	ATTAT	2	10	294712	294721	40 %	60 %	0 %	0 %	222102244
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5099	NC_011987	AG	3	6	295118	295123	50 %	0 %	50 %	0 %	222102245
5100	NC_011987	GGCTTT	2	12	295152	295163	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222102245
5101	NC_011987	GCA	2	6	295182	295187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102245
5102	NC_011987	ATG	2	6	295188	295193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102245
5103	NC_011987	AAC	2	6	295319	295324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102245
5104	NC_011987	GCC	3	9	295362	295370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102245
5105	NC_011987	CGAT	2	8	295377	295384	25 %	25 %	25 %	25 %	222102245
5106	NC_011987	AGGG	2	8	295435	295442	25 %	0 %	75 %	0 %	222102245
5107	NC_011987	TAG	2	6	295505	295510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102245
5108	NC_011987	GATCG	2	10	295556	295565	20 %	20 %	40 %	20 %	222102245
5109	NC_011987	CAGG	2	8	295720	295727	25 %	0 %	50 %	25 %	222102246
5110	NC_011987	TGGC	2	8	295826	295833	0 %	25 %	50 %	25 %	222102246
5111	NC_011987	C	6	6	295862	295867	0 %	0 %	0 %	100 %	222102246
5112	NC_011987	GAA	2	6	295888	295893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102246
5113	NC_011987	TGA	2	6	295896	295901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102246
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5115	NC_011987	GA	3	6	296111	296116	50 %	0 %	50 %	0 %	222102246
5116	NC_011987	GC	3	6	296142	296147	0 %	0 %	50 %	50 %	222102246
5117	NC_011987	CCG	2	6	296162	296167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102246
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5119	NC_011987	CGT	2	6	296271	296276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102246
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5121	NC_011987	GA	3	6	296543	296548	50 %	0 %	50 %	0 %	222102246
5122	NC_011987	CGAT	2	8	296570	296577	25 %	25 %	25 %	25 %	222102246
5123	NC_011987	GAA	2	6	296596	296601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102246
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5143	NC_011987	CGT	2	6	297499	297504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102247
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5147	NC_011987	GAT	2	6	297632	297637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102247
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5238	NC_011987	CGC	2	6	302458	302463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102251
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5241	NC_011987	ACCA	2	8	302589	302596	50 %	0 %	0 %	50 %	222102251
5242	NC_011987	ATT	2	6	302600	302605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102251
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5262	NC_011987	CTGG	2	8	304107	304114	0 %	25 %	50 %	25 %	222102253
5263	NC_011987	CGA	2	6	304167	304172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102253
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5273	NC_011987	CCGGC	2	10	304628	304637	0 %	0 %	40 %	60 %	222102253
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5275	NC_011987	CCG	2	6	304737	304742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102253
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5302	NC_011987	ATC	2	6	306130	306135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102254
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5350	NC_011987	GATC	2	8	308088	308095	25 %	25 %	25 %	25 %	222102256
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5354	NC_011987	GCAG	2	8	308186	308193	25 %	0 %	50 %	25 %	222102256
5355	NC_011987	CAA	2	6	308230	308235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102256
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5357	NC_011987	AGCG	2	8	308294	308301	25 %	0 %	50 %	25 %	222102256
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5362	NC_011987	ATC	2	6	308489	308494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102256
5363	NC_011987	CG	3	6	308528	308533	0 %	0 %	50 %	50 %	222102257
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5369	NC_011987	GAA	2	6	308778	308783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102257
5370	NC_011987	ATC	2	6	308821	308826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102257
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5375	NC_011987	TGG	2	6	308978	308983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102257
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5383	NC_011987	GCA	2	6	309302	309307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102257
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5390	NC_011987	ACGA	2	8	309546	309553	50 %	0 %	25 %	25 %	222102257
5391	NC_011987	CGA	2	6	309647	309652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102257
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5394	NC_011987	CAT	2	6	309770	309775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102257
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5443	NC_011987	CGC	2	6	311726	311731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102259
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5465	NC_011987	ATCA	2	8	312801	312808	50 %	25 %	0 %	25 %	222102259
5466	NC_011987	GAC	2	6	312819	312824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102259
5467	NC_011987	TTAC	2	8	313022	313029	25 %	50 %	0 %	25 %	222102260
5468	NC_011987	TGGT	2	8	313110	313117	0 %	50 %	50 %	0 %	222102260
5469	NC_011987	CGG	2	6	313120	313125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102260
5470	NC_011987	CCA	3	9	313130	313138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102260
5471	NC_011987	CTT	2	6	313260	313265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102260
5472	NC_011987	GCG	2	6	313292	313297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102260
5473	NC_011987	CTG	2	6	313320	313325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102260
5474	NC_011987	GCT	2	6	313394	313399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102260
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5477	NC_011987	GAA	2	6	313593	313598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102260
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5480	NC_011987	CGG	2	6	313735	313740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102260
5481	NC_011987	GC	3	6	313765	313770	0 %	0 %	50 %	50 %	222102260
5482	NC_011987	AGA	2	6	313792	313797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102260
5483	NC_011987	CCG	2	6	313841	313846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102260
5484	NC_011987	GCA	2	6	313859	313864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102260
5485	NC_011987	GCC	2	6	313867	313872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102260
5486	NC_011987	GCC	2	6	313884	313889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102260
5487	NC_011987	GAC	2	6	313896	313901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102260
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5489	NC_011987	TGC	2	6	314208	314213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102261
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5491	NC_011987	GGC	2	6	314348	314353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102261
5492	NC_011987	GC	4	8	314377	314384	0 %	0 %	50 %	50 %	222102261
5493	NC_011987	ATCG	2	8	314393	314400	25 %	25 %	25 %	25 %	222102261
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